O Conselho Fiscal é um dos órgãos de fiscalização da Ebserh e é integrado pelos seguintes membros:

José Fernando Uchôa Costa Neto (presidente do Conselho)
Representação: Ministério da Educação

Titular: Stela Maris Monteiro Simão
Suplente: Anelize Lenzi Ruas de Almeida
Representação: Ministério da Fazenda

Titular: Georgenor Cavalcante Pinto
Suplente: Aguardando nomeação
Representação: Ministério da Saúde

São atribuições do Conselho Fiscal:

• fiscalizar, por qualquer de seus membros, os atos dos administradores e verificar o cumprimento dos seus deveres legais e estatutários;
• opinar sobre o relatório anual da administração e demonstrações financeiras do exercício social;
• opinar sobre a modificação do capital social, planos de investimento ou orçamentos de capital, transformação, incorporação, fusão ou cisão;
• denunciar, por qualquer de seus membros, os erros, fraudes ou crimes que descobrirem, e sugerir providências úteis;
• analisar, ao menos trimestralmente, o balancete e demais demonstrações financeiras elaboradas periodicamente pela Ebserh; e
• acompanhar a execução patrimonial, financeira e orçamentária, podendo examinar livros e quaisquer outros documentos e requisitar informações.