O Programa Nacional de Reestruturação dos Hospitais Universitários Federais (Rehuf) tem como diretrizes:
Instituição de mecanismos adequados de financiamento, igualmente compartilhados entre as áreas da educação e da saúde;
Melhoria dos processos de gestão;
Adequação da estrutura física;
Recuperação e modernização do parque tecnológico;
Reestruturação do quadro de recursos humanos dos hospitais universitários federais; e
Aprimoramento das atividades hospitalares vinculadas ao ensino, pesquisa e extensão, bem como à assistência à saúde, com base em avaliação permanente e incorporação de novas tecnologias em saúde.